Doktorand inom AI-system för Virtuell Cell

Projektbeskrivning

Forskarutbildningsämne: Biologisk fysik

AICell Lab (https://aicell.io) vid institutionen för tillämpad fysik vid KTH och Science for Life Laboratory är en ny forskargrupp finansierad av programmet Datadriven Life Science Fellows. Gruppen, ledd av Wei Ouyang, fokuserar på att bygga AI-system för datadriven cell- och molekylärbiologi. För att utöka teamet öppnar vi nu en tjänst för en doktorand i biologisk fysik med fokus på robotik och AI-driven mikroskopi.

Detta projekt fokuserar på att utveckla ett multi-agent AI-system för datadriven cellbiologi som koordinerar datainsamling, analys, visualisering och hypotesgenerering i en digital tvilling av cellen. Vi strävar efter att koppla samman experiment och beräkning i en enhetlig plattform driven av stora språkmodeller (LLMs), grundmodeller och interaktiva verktyg.

Som doktorand kommer du att:

• Designa och bygga fullstack-AI-system som interagerar med realtidsdata från experiment, driver storskaliga simuleringar och integrerar människa-i-loopen-arbetsflöden.
• Träna och finjustera djupinlärningsmodeller, inklusive transformermodeller och LLMs, för att förstå biologisk data, styra system och resonera vetenskapligt.
• Utveckla agentbaserade arbetsflöden där AI-modeller kan koppla samman verktyg, API:er och dataset för att fatta informerade vetenskapliga beslut autonomt.
• Vara med och forma framtidens forskningsinfrastruktur genom att bidra till en plattform som omdefinierar hur vi utforskar och modellerar levande system.

Handledning: Professor Hjalmar Brismar och biträdande professor Wei Ouyang föreslås handleda doktoranden. Beslut tas vid antagning

Vi erbjuder

• Möjligheten att doktorera i en dynamisk, internationell forskarmiljö i samarbete med industrin och framstående universitet världen över.
• En arbetsplats med många anställningsförmåner och månadslön enligt KTH: s avtal för doktorandlöner.
• Forskarutbildning vid ett lärosäte som är aktivt och stöttande i frågor som rör t.ex. arbetsvillkor, jämställdhet och mångfald samt studiemiljö.
• Lärande och att frodas i en ung och ambitiös forskargrupp.

Behörighet för antagning

För att bli antagen till forskarutbildning (kap 7 39 § högskoleförordningen) krävs att den sökande har grundläggande behörighet:

• avlagt en examen på avancerad nivå, eller
• fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
• på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Utöver ovanstående  finns också ett obligatoriskt krav på engelska motsvarande Engelska B/6.

Urval

För att lyckas med dina doktorandstudier på KTH behöver du vara målinriktad och ihärdig i ditt arbete. Vid urval av de sökande bedöms förmågan att:

• självständigt driva sitt arbete framåt,
• kunna samarbeta med andra,
• ha ett professionellt förhållningssätt och
• analysera och arbeta med komplexa frågor.
• Starka programmeringskunskaper i Python och moderna webb-ramverk; erfarenhet av att bygga och underhålla fullstack-applikationer.
• Praktisk erfarenhet av att träna AI-modeller, särskilt djupinlärningsarkitekturer som transformatorer, diffusionsmodeller eller stora språkmodeller.
• Förtrogenhet med molninfrastruktur, containerisering, Kubernetes och datapipelines för vetenskapliga eller industriella tillämpningar.
• Förmåga att arbeta självständigt och hantera tiden effektivt, samtidigt som långsiktiga och komplexa mål drivs framåt.
• Erfarenhet av att arbeta i tvärvetenskapliga team, gärna i forskningsmiljöer inom livsvetenskap, fysik eller teknik.

Efter behörighetskraven kommer stor vikt läggas vid personliga egenskaper.

Målexamen: Doktorexamen

Information om antagning och anställning 

Endast den som antagits till forskarutbildning får anställas som doktorand. Den sammanlagda anställningstiden får inte vara längre än vad som motsvarar utbildning på forskarnivå på heltid under fyra år. En anställd doktorand kan i begränsad omfattning (högst 20 %) utföra vissa arbetsuppgifter inom t.ex. utbildning och administration. En ny anställning som doktorand gäller för högst ett år, anställningen får därefter förnyas med högst två år i taget. 

Fackliga representanter

Kontaktuppgifter till fackliga representanter.

Doktorandsektionen (Tekniska högskolans studentkår)

Kontaktuppgifter till doktorandsektionen.

Ansökan 

Du ansöker via KTH:s rekryteringssystem. Du som sökande har huvudansvaret för att din ansökan är komplett när den skickas in.

Ansökan ska vara KTH tillhanda senast sista ansökningsdagen vid midnatt, CET/CEST (Central European Time/Central European Summer Time). 

Ansökan ska ha följande innehåll

• CV med relevanta professionella erfarenheter och kunskaper.
• Ansökningsbrev med en kortfattad redogörelse om varför du vill bedriva forskarstudier, om dina akademiska intressen och hur de relaterar till dina tidigare studier och framtida mål. (Max 2 sidor)
• Kopior av examensbevis och betyg från tidigare universitetsstudier och intyg på uppfyllda språkkrav (se ovan). Översättningar till engelska eller svenska om originaldokumentet inte är utfärdade på ett av dessa språk. Kopior av original ska vidimeras 
• Representativa publikationer eller tekniska rapporter. För längre dokument, bifoga gärna en sammanfattning (abstract) och en webblänk till den fullständiga texten

Övrigt

Strävan efter jämställdhet, mångfald och lika villkor är både en kvalitetsfråga och en självklar del av KTH:s värdegrund

För information om behandling av personuppgifter i samband med rekrytering.

Det kan förekomma att en anställning hos KTH är placerad i säkerhetsklass. Om så är fallet för just denna anställning görs en säkerhetsprövning av sökande i enlighet med säkerhetsskyddslagen (2018:585) efter samtycke. I dessa fall är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd efter säkerhetsprövning.

Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.