Postdoktor inom bioinformatik och integrativ omik - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Arbetsuppgifter

Forskargruppen inom Integrativ omik och precisionsmedicin på CBH-skolan leds av professor Mathias Uhlén och har sina lokaler på SciLifeLab Stockholm. Huvudprojektet för denna grupp är ”Human Protein Atlas”-projektet (www.proteinatlas.org) och vi ska nu rekrytera en postdoc med stark bioinformatikbakgrund till projektet “Visual Analytics for Enhancing Quality and Trust in Genome-wide Expression Clustering and Annotation”.

Det finns ett behov av att göra en funktionell helgenomsannotering av de proteinkodande generna för att få en djupare förståelse av däggdjursbiologi. Inom detta projekt kommer en ny datadriven strategi utvecklas baserad på tydbar, icke-väglett lärande av gener med samvarierande uttryck över kroppens alla vävnader med hjälp av spjutsspetsteknik inom visuell analys. Interaktiv guidning av klustringsprocessen kommer användas för att utforska genuttryckslandskapet i människan, samt i andra däggdjur, för att kartlägga alla proteinkodande gener i alla större celltyper, vävnader och organ. Målet för denna postdoc-position är forskning och utveckling av denna klustringsstrategi för att genomföra analyser av storskaligt data. Arbetsuppgifterna inbegriper deltagande i forskningsarbete inom avdelningen för systembiologi på Institutionen för Proteinvetenskap, KTH Solna campus och SciLifeLab.

Denna position är en del av ett samarbete mellan de två största forskningsprogrammen i Sverige, Wallenberg AI, Autonomous Systems and Software Program, (WASP) samt SciLifeLabs och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap (Data-Driven Life Science, DDLS). Målet är att lösa banbrytande tvärdisciplinära forskningsfrågor.

SciLifeLabs och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap (Data-Driven Life Science, DDLS) är ett 12-årigt initiativ fokuserat på datadriven forskning inom områden som är nödvändiga för att förbättra människors liv, upptäcka och behandla sjukdomar, skydda biodiversitet och skapa hållbarhet. Programmet kommer att utbilda och stötta nästa generation av forskare inom livsvetenskap och skapa en stark datavetenskaplig bas. Programmet avser stärka nationella samarbeten mellan universitet, koppla samman forskare inom livs- och datavetenskap samt att skapa samarbeten med industri, sjukvården och andra nationella och internationella aktörer. Läs mer: https://www.scilifelab.se/data-driven

Wallenberg AI, Autonomous Systems and Software Program, WASP, är Sveriges största enskilda forskningsprogram i modern tid. Programmet skapar en plattform för akademisk forskning och utbildning i nära samarbete med ledande svensk teknikintensiv industri. Forskningen innefattar artificiell intelligens och autonoma system som verkar i samarbete med människor och som anpassar sig till sin omgivning med hjälp av sensorer, information och kunskap och skapar intelligenta system av system. WASPs vision är excellent forskning och kompetens inom artificiell intelligens, autonoma system och mjukvara till gagn för svensk industri. Läs mer: https://wasp-sweden.org/

Vi erbjuder

• En anställning på ett ledande tekniskt universitet som skapar kunskap och kompetens för en hållbar framtid
• Engagerade och ambitiösa kollegor samt en kreativ, internationell och dynamisk miljö
• Ett nära samarbete med forskargrupper på Linköpings Universitet samt Linnéuniversitetet i Växjö
  Läs mer om hur det är att arbeta på KTH.

Kvalifikationer

Krav

• Avlagd doktorsexamen inom bioinformatik, biostatistik, bioteknologi, datavetenskap eller liknande (eller utländsk examen som bedöms motsvara en doktorsexamen), som har avlagts högst tre år före ansökningstidens utgång (med vissa undantag för särskilda skäl såsom perioder av sjuk- eller föräldraledighet, vänlige ange om sådant skäl föreligger i ditt CV).
• Den sökande skall ha en stark bakgrund i bioinformatik, datavetenskap, beräkningsbiologi eller motsvarande med en djupgående kunskap inom biologi och biostatistik och urvalet kommer baseras på meriter och färdigheter.
• God kunskap och erfarenhet av metoder för klustring och dimensionsreducering
• Dokumenterad och omfattande erfarenhet av hantering, visualisering, analys och integration av storskaliga multi-dimensionella biologiska dataset. God kännedom om bioinformatiska verktyg, paket, algoritmer och databaser.
• Avancerade färdigheter inom programmering, främst i R, Python eller Perl, samt erfarenhet av att arbeta i en UNIX/LINUX miljö.

Vidare ser vid att du har en god pedagogisk förmåga med en hög vetenskaplig skicklighet liksom problemlösande analysförmåga. Vi ser gärna att du kan arbeta strukturerat, har en hög grad av självständighet, samt en god förmåga att lätt kunna samarbeta med andra. Det är också viktigt att du visar god förmåga att muntligt och skriftligt kommunicera och presentera forskning på engelska då det krävs i det dagliga arbetet.

Meriterande

Meriterande är att du har en medvetenhet om mångfalds- och likabehandlingsfrågor med särskilt fokus på jämställdhet.

Vi kommer att lägga stor vikt vid personliga egenskaper.

Fackliga representanter

Du hittar kontaktuppgifter till fackliga representanter på KTH:s webbsida.

Ansökan

Du ansöker via KTH:s rekryteringssystem. Du som sökande har huvudansvaret för att din ansökan är komplett när den skickas in.

Ansökan ska vara KTH tillhanda senast sista ansökningsdagen vid midnatt, CET/CEST (Central European Time/Central European Summer Time).

Om anställningen

Anställningen gäller tillsvidare dock längst 2 år. 

En anställning som postdoktor är en tidsbegränsad meriteringsanställning med huvudinriktning mot forskning avsedd som ett första karriärsteg efter disputation.

Övrigt

Strävan efter jämställdhet, mångfald och lika villkor är både en kvalitetsfråga och en självklar del av KTH:s värdegrund.

För information om behandling av personuppgifter i samband med rekrytering läs mer här.

Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.