Kungliga Tekniska högskolan,

Tjänsten kommer att vara placerad vid Institutionen för Genteknologi, KTH förlagt till Science for Life Laboratory i Stockholm invid Karolinska Institutet.

Arbetsuppgifter

Arbetet kommer att bestå av utveckling av bioinformatik/beräkningsmetodik för att studera genuttryck i enskilda celler och i vävnadssnitt som kombineras med bilddata. Ett speciellt fokus är på spatial transkriptomics tekniken (Ståhl et al Science 2016; Salmen et al. Nat Prot 2018), utvecklat i ett samarbete mellan KTH och KI, som ger en beskrivning av mRNA vävnadssnitt (dvs RNA seq och imaging data). Det föreslagna projektet syftar till att inkluderas som en del av projektet Human Developmental Atlas Atlas vid SciLifeLab.

I detta projekt använder vi ett flertal verktyg som scRNA Seq, spatial transcriptomics, in situ-sekvensering och CODEX-proteinanalys för att beskriva och katalogisera gener som är involverade i mänsklig utveckling av hjärnan, hjärtat och lungorna. En nyckelkomponent för den utlysta positionen är att ge ny biologisk kunskap till de studerade systemen som kräver viss förståelse för de undersökta vävnaderna. Detta projekt kommer att vara i samarbete med interna och externa experimentella och bioinformatikforskare.

Kvalifikationer

Den sökande kandidaten skall ha en doktorsexamen (eller motsvarande) inom datavetenskap, matematik, fysik, bioinformatik, molekylärbiologi, bioteknik eller relaterat område med stark bakgrund och kunskap om molekylärbiologi. Grundlig erfarenhet av Unix (eller en variant därav), R, skriptprogramvara (t ex Python) eller andra programmeringsspråk, såsom C ++, krävs.

Erfarenhet av hantering av stora sekvenseringsdatasatser och utveckling av bioinformatik metoder är mycket önskvärt. Möjligheten att arbeta både självständigt och samarbetet är högt värderat. Mycket goda kunskaper i engelska både skriftligt och i tal är ett krav. Postdoktor / Forskare kommer att vara anställd vid KTH Kungliga Tekniska Högskolan och arbetsplatsen är på SciLifeLab Stockholm.

Fackliga representanter

Du hittar kontaktuppgifter till fackliga representanter på KTH:s webbsida

Ansökan

Ansökan skall innefatta följande handlingar:
1. Curriculum vitae (1-2 sidor)
2. Betygsavskrift från högskolan/universitet eller motsvarande
3. Kortfattad redogörelse varför den sökande är intresserad av tjänsten.
4. Kontaktinformation till ett par referenspersoner.

Du ansöker via KTH:s rekryteringssystem. Du som sökande har huvudansvaret för att din ansökan är komplett när den skickas in.

Ansökan ska vara KTH tillhanda senast sista ansökningsdagen vid midnatt, CET/CEST (Central European Time/Central European Summer Time). 

Övrigt

Jämställdhet, mångfald och avståndstagande från alla former av diskriminering är både en kvalitetsfråga och en självklar del av KTH:s värdegrund.

För information om Behandling av personuppgifter i samband med rekrytering läs mer här.

Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.

Anställningsform Tidsbegränsad anställning
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde Enligt överenskommelse
Löneform Månadslön
Antal lediga befattningar 2
Sysselsättningsgrad 100%
Ort Solna
Län Stockholms län
Land Sverige
Referensnummer C-2018-2007
Kontakt
  • Joakim Lundeberg, Professor, joakim.lundeberg@scilifelab.se
Publicerat 2018-12-21
Sista ansökningsdag 2019-02-01

Tillbaka till lediga jobb