Doktorand, Droppbaserad detektion av DNA, RNA & proteiner i enskilda celler - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Projektbeskrivning

Forskarutbildningsämne: Bioteknologi

Vi söker en doktorand intresserad av att utveckla molekylära & bioinformatiska metoder för analys av enskilda celler. Institutionen för Genteknologi, avdelningen för Experimental Genomik utlyser härmed en doktorandplats för ”Droppbaserad detektion av DNA, RNA och proteiner i enskilda celler”. Institutionen för Genteknologi är ledande inom utveckling av molekylär metod & som doktorand kommer du till en internationell och kreativ arbetsplats.

Projektet handlar om att studera kroppens immunförsvar. Kroppens immunförsvar är mycket komplext och består av en mängd olika typer av celler som har olika uppgifter vilket gör att informationen som erhålls om man analyserar hela cellpopulationen kan vara svår att tolka. Om man däremot kunde analysera cellerna en och en, med en känslig metod för att kunna mäta förekomst och nivåer av biomolekyler, skulle man få en ökad förståelse av de enstaka immuncellernas funktion. I detta projekt kombinerar vi expertis från olika vetenskapsområden för att utveckla nya metoder för analys av DNA, RNA och proteiner i enstaka immunceller. Projektet är baserat på en ny ”linked-read sequencing” teknologi kallad ”single cell droplet barcode sequencing (scDBS)” som ska möjliggöra samtidigt analys av alla beståndsdelar i centrala dogmat av molekylär biologi i enskilda immunceller.

Projektet är multidisciplinär och som doktorand kommer du att bli expert inom analys av enstaka celler i emulsionsdroppar och utveckling av bioinformatiska verktyg. Att ha bakgrund och erfarenhet inom dessa områden är således meriterande.

Handledning: Doktoranden kommer att handledas av: Prof. Afshin Ahmadian

Vi erbjuder

• Möjligheten att doktorera i en dynamisk, internationell forskarmiljö i samarbete med industrin och framstående universitet världen över Läs mer
• En arbetsplats med många anställningsförmåner och månadslön enligt KTH: s avtal för doktorandlöner.
• Forskarutbildning vid ett lärosäte som är aktivt och stöttande i frågor som rör t.ex. arbetsvillkor, jämställdhet och mångfald samt studiemiljö.

Behörighet för antagning

För att bli antagen till forskarutbildning (kap 7 39 § högskoleförordningen) krävs att den sökande har grundläggande behörighet:

• avlagt en examen på avancerad nivå,
• fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
• på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Utöver ovanstående  finns också ett obligatoriskt krav på engelska motsvarande Engelska B/6, läs mer här.

Urval

För att lyckas med dina doktorandstudier på KTH behöver du vara målinriktad och ihärdig i ditt arbete. Vid urval av de sökande bedöms förmågan att:

• självständigt driva sitt arbete framåt
• kunna samarbeta med andra
• ha ett professionellt förhållningssätt och
• analysera och arbeta med komplexa frågor

Meriterande:

• singel cell tekniker
• emulsions tekniker
• biblioteksberedning för storskalig sekvensering
• storskalig sekvensering
• analys av data från storskalig sekvensering
• utveckling och analys av linked-read sekvenseringsdata
• ”high performance computing systems” såsom UPPMAX
• programmering inom Python och R

Efter behörighetskraven kommer stor vikt läggas vid personliga egenskaper.

Målexamen: Doktorsexamen

Information om antagning och anställning 

Endast den som antagits till forskarutbildning får anställas som doktorand. Den sammanlagda anställningstiden får inte vara längre än vad som motsvarar utbildning på forskarnivå på heltid under fyra år. En anställd doktorand kan i begränsad omfattning (högst 20 %) utföra vissa arbetsuppgifter inom t.ex. utbildning och administration. En ny anställning som doktorand gäller för högst ett år, anställningen får därefter förnyas med högst två år i taget

Fackliga representanter

Du hittar kontaktuppgifter till fackliga representanter på KTH:s webbsida.

Doktorandsektionen (Tekniska högskolans studentkår)

Du hittar kontaktuppgifter till doktorandsektionen på sektionens webbsida.

Ansökan 

Du ansöker via KTH:s rekryteringssystem. Du som sökande har huvudansvaret för att din ansökan är komplett när den skickas in.

Ansökan ska ha följande innehåll

• CV med relevanta professionella erfarenheter och kunskaper
• Ansökningsbrev med en kortfattad redogörelse om varför du vill bedriva forskarstudier, om dina akademiska intressen & hur de relaterar till dina tidigare studier & framtida mål. (Max 2 sidor)
• Kopior av examensbevis & betyg från tidigare universitetsstudier & intyg på uppfyllda språkkrav (se ovan). Översättningar till engelska eller svenska om originaldokumentet inte är utfärdade på ett av dessa språk.
• Representativa publikationer eller tekniska rapporter. För längre dokument, bifoga gärna en sammanfattning (abstract) och en webblänk till den fullständiga texten

Ansökan ska vara KTH tillhanda senast sista ansökningsdagen vid midnatt, CET/CEST (Central European Time/Central European Summer Time)

Övrigt

Strävan efter jämställdhet, mångfald och lika villkor är både en kvalitetsfråga & en självklar del av KTH:s värdegrund

För information om behandling av personuppgifter i samband med rekrytering läs mer här.

Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser